Παρελθόν από την Μπάγερν αποτελεί ο τεχνικός διευθυντής Μάρκο Νέπε.
Όπως έγινε γνωστό, οι Βαυαροί και ο 37χρονος παράγοντας συμφώνησαν να λύσουν από κοινού τη συνεργασία τους, επιβεβαιώνοντας τις φήμες που έκαναν λόγο για απομάκρυνση του Νέπε το τελευταλιο διάστημα.
Ο Νέπε δούλεψε σε διάφορες θέσεις στην Μπάγερν, από το καλοκαίρι του 2014 όταν πήρε... μεταγραφή από τη Λεβερκούζεν ως σκάουτερ.
Τον Δεκέμβριο του 2021 ανέλαβε χρέη τεχνικού διευθυντή στον σύλλογο, αλλά κατόπιν έχασε μέρος των αρμοδιοτήτων του με τις προσλήψεις πρώτα του Κρίστοφ Φρόιντ και μετά του Μαξ Έμπερλ.